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短信扣费查商户的方法有多种，以下提供几种途径。
1、第三方支付平台查询：可以通过支付宝、微信等第三方支付平台的账单查询功能，查看交易记录并找到相应的扣款记录，查看扣款商户信息。
2、手机银行查询：在手机银行APP中可以查询交易明细，找到相应的扣款记录并查看扣款商户信息。
3、运营商查询：可以联系手机运营商客服，查询短信扣费明细，运营商会告知扣费商户信息。
4、账单查询：如果短信扣费是由某个商户发起的，可以在相关商户的账单中查找相应的交易记录。
无论通过哪种方式查询，为了保护个人信息和资金安全，请确保查询过程中使用的网络环境安全，避免泄露个人信息，如果仍然无法确定扣费商户，建议联系相关银行或支付机构客服协助处理。